Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms