Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tvp23bQ9D8T4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms