Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ifi35Q9D8C4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifi35Q9D8C4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms