Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
U2af1Q9D883 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms