Protein–RNA interactions for Protein: Q9D832

Dnajb4, DnaJ homolog subfamily B member 4, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb4Q9D832 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnajb4Q9D832 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms