Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rep15Q9D7T1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rep15Q9D7T1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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