Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf13Q9D777 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf13Q9D777 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms