Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc9bQ9D6E4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms