Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms