Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Phf6Q9D4J7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf6Q9D4J7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms