Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam90a1bQ9D4F3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam90a1bQ9D4F3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms