Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms