Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx29Q9D3S3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms