Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnal2Q9D3R6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnal2Q9D3R6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnal2Q9D3R6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnal2Q9D3R6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnal2Q9D3R6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Katnal2Q9D3R6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Katnal2Q9D3R6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms