Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chordc1Q9D1P4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms