Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H0

Rita1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rita1Q9D1H0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rita1Q9D1H0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms