Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syf2Q9D198 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syf2Q9D198 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms