Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm12Q9D0R8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms