Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed3Q9D0L1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms