Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pbdc1Q9D0B6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pbdc1Q9D0B6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms