Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim13Q9CYB0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms