Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bud23Q9CY21 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms