Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufs4Q9CXZ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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