Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms