Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tdrd12Q9CWU0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tdrd12Q9CWU0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms