Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx10Q9CWT3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms