Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Raver1Q9CW46 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Raver1Q9CW46 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms