Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
2310003L06RikQ9CV82 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2310003L06RikQ9CV82 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2310003L06RikQ9CV82 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2310003L06RikQ9CV82 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2310003L06RikQ9CV82 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms