Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sppl3Q9CUS9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms