Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms