Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud1Q9CUB6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms