Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp13a2Q9CTG6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp13a2Q9CTG6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms