Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ska2Q9CR46 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms