Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rer1Q9CQU3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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