Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim8Q9CQQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms