Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpb2Q9CQI7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms