Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpsQ9CQC2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms