Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb3bpQ9CQ82 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb3bpQ9CQ82 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms