Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpa3Q9CQ71 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpa3Q9CQ71 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms