Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
StambpQ9CQ26 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
StambpQ9CQ26 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms