Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe41Q99PV5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms