Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim8Q99PJ2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim8Q99PJ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms