Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b1Q99NB9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b1Q99NB9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms