Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mrpl43Q99N89 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mrpl43Q99N89 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mrpl43Q99N89 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mrpl43Q99N89 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mrpl43Q99N89 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mrpl43Q99N89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mrpl43Q99N89 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl43Q99N89 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms