Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms