Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp1b4Q99ME6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1b4Q99ME6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms