Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprtQ99M80 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprtQ99M80 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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