Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp16Q99LG0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp16Q99LG0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms