Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TriobpQ99KW3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms