Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf34Q99KR6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf34Q99KR6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms